Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf8Q9EQH4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms