Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r29Q9EQ41 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms