Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms