Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfgap1Q9EPJ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgap1Q9EPJ9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms