Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc38a3Q9DCP2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc38a3Q9DCP2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms