Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxp4Q9DBY0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms