Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf6Q9DBU5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf6Q9DBU5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms