Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Riok3Q9DBU3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms