Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Swt1Q9DBQ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Swt1Q9DBQ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms