Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBP5

Cmpk1, UMP-CMP kinase, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk1Q9DBP5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cmpk1Q9DBP5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmpk1Q9DBP5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms