Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9DA42 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9DA42 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DA42 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DA42 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DA42 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DA42 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DA42 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DA42 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9DA42 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9DA42 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9DA42 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms