Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms