Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhc1Q9D9T8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhc1Q9D9T8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms