Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e2Q9D902 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms