Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot8Q9D8X5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms