Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tvp23bQ9D8T4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms