Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8N1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8N1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8N1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8N1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8N1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8N1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8N1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms