Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms