Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf13Q9D777 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms