Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Borcs8Q9D6Y4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Borcs8Q9D6Y4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Borcs8Q9D6Y4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms