Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc94Q9D6J3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc94Q9D6J3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms