Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H5

Zdhhc4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc4Q9D6H5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zdhhc4Q9D6H5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zdhhc4Q9D6H5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms