Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc9bQ9D6E4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ttc9bQ9D6E4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms