Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23bQ9D662 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23bQ9D662 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms