Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip1Q9D620 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms