Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc7Q9D541 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc7Q9D541 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms