Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4933402D24RikQ9D4D3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933402D24RikQ9D4D3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms