Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sohlh2Q9D489 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms