Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpn3Q9D3W4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms