Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd2Q9D3B1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms