Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rufy3Q9D394 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms