Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1cQ9D300 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms