Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms