Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms