Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zbed3Q9D0L1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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