Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pbdc1Q9D0B6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms