Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Ccdc47Q9D024 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Ccdc47Q9D024 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Ccdc47Q9D024 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc47Q9D024 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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