Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms