Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nip7Q9CXK8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms