Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd12Q9CWU0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms