Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud1Q9CUB6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms