Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms