Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms