Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nicn1Q9CQM0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nicn1Q9CQM0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nicn1Q9CQM0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nicn1Q9CQM0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms