Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf138Q9CQE0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf138Q9CQE0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf138Q9CQE0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf138Q9CQE0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf138Q9CQE0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf138Q9CQE0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138Q9CQE0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms