Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms