Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms