Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPN7

1810009J06Rik, RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810009J06RikQ9CPN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1810009J06RikQ9CPN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms