Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms