Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcg3Q99P81 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcg3Q99P81 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms